Die Osaki Station wird durch die East Japan Railway Company (JR East) und Tokyo Waterfront Area Rapid Transit (TWR) gemeinsam betrieben. Die Station verfügt über vier Inselbahnsteige welchen insgesamt 8 Geleise angeliedert sind. Die Plattformen 1 - 4 sind für die Yamanote-Linie, die Plattformen 5 - 8 teilen sich die Saikyo-Linie, die Shonan-Shinjuku-Linie und die Rinkai-Linie. An dieser Station werden die Züge auf der Yamanote-Linie in Schleife gelegt und können somit aus dem Verkehr gezogen werden. Aus diesem Grund hat es insgesamt vier Spuren (zwei in jede Richtung).