Auch die Yoyogi Station befindet sich im Stadtbezirk Shibuya, Tokio und wird von der East Japan Railway Company (JR East) und der Tokyo Metropolitan Bureau of Transportation (Toei) bewirtschaftet.

Die Station wurde am 23. Oktober 1906 von einer privaten Firma als eine Station auf der Chuo-Hauptlinie eröffnet. Nach gerade einmal einer Woche Betriebszeit wurde diese Station durch die Japanese National Railways verstaatlicht. Die angegliederte U-Bahn-Station Toei Oedo wurde am 20. April 2000 eröffnet.